Původně bylo muzeum zřízeno jako regionální muzeum. Základem sbírky jsou archeologické artefakty z vykopávek v oblasti raně středověkého Kolobřehu vedených prof. Lecha Leciejewicze a několik památek z předválečného muzea, které z trosek vykopal významný turistický aktivista Jan Frankowski.
Muzeum se nachází v nájemním domě z 15. století v ul., přestavěném speciálně pro tento účel. podporučík Emilii Gierczak 5. Původně bylo plánováno dát zařízení historicko-městský charakter, poté historicko-námořní. Nakonec byl v roce 1966 zvolen historicko-vojenský profil.
